科學邊界當中的宇宙閃爍指的是在觀測宇宙過程中星光或其他天體輻射產生微小或快速的亮度變化，導致這種宇宙閃爍的原因比較多，宇宙微波背景輻射是導致宇宙閃爍的最重要原因之一，宇宙微波背景輻射是宇宙大爆炸之后所遺留下來的熱輻射，這種輻射擁有各項同性和均勻等性質，是宇宙大爆炸理論驗證的一個重要預測，人類在1965年的時候首次探測到宇宙微波背景輻射。
宇宙微波背景輻射在宇宙當中是均勻分布的，他本身并不會導致星光或其他的天體閃爍，但是宇宙當中的一些其他現象和宇宙微波背景輻射產生相互作用，就會導致宇宙閃爍現象出現，比如宇宙中的物質分布不均勻，一些天體的引力場會對周圍的光線產生折射或者是引力透鏡的效應，會導致星光傳播過程中出現偏移，這些偏移在地球上的觀測者看來會發生微小的亮度變化，也就形成宇宙閃爍的現象。
宇宙中的一些高能粒子可以和他星光以及其天體輻射相互作用，這些高能粒子包括宇宙射線和中微子等等，一旦發生作用就會產生出新的光子，或者直接改變光子的能量以及運行方向，從而延伸出宇宙閃爍的現象，宇宙中的磁場對光子的傳播同樣會有一些影響，宇宙磁場會改變光子的能量和偏振方向，這種情況會導致宇宙閃爍的現象出現。
上述的這些原因是導致宇宙閃爍出現的部分原因，實際上宇宙閃爍的具體出現機制還會更加的復雜，而且三體小說當中科學邊界所做出的宇宙閃爍是被用于虛擬的通信方式或一種科學元素，與現實科學或有所不同，所以在理解科學邊界宇宙閃爍的具體原因時，人們也要綜合多種因素來去區分現實以及虛擬情況。
